Tak jak spotkaliśmy się ze skamielinami rzadkich Pokemonów w pierwszych grach Red/Blue, tak i tu mamy możliwość wyboru rzadkiej skamieliny z której zostanie ożywiony pokemon. Do wyboru mamy dwie skamieliny:

• Root Fossil
• Claw Fossil

Jeśli wybierzmy tą pierwszą mamy szansę mieć Lileepa a z drugiej Anoritha.

Skamielny znajdują się poniżej na pustyni. Jeśli już mamy skamielinę, udajemy się do Rustboro, do budynku Devon Corp. Tam rozmawiamy z osobą na I piętrze. Po kilkunastu krokach od wyjścia z budynku wracamy i odbieramy Pokemona ze skamieliny.